W dniu 29.04.2020 wdrożono na środowisko testowe (DEMO) nową wersję systemu v2.0.0, która wprowadza integrację danych z POLon2. Zaktualizowanie integracji było niezbędne aby dwa systemy JSA i POLon2 mogły nadal działać używając tych samych danych.  Nowa architektura POLon2 fundamentalnie zmieniła identyfikację obiektów w JSA. Zmiany dotyczą interfejsu użytkownika jak i w API. Wszystkie zmiany zostały opisane tutaj oraz dokumentacja API została dostosowana i znajduje się tutaj.
Wersja systemu wprowadza zmiany związane z integracją POLon2, które blokują, zarówno w UI jak i w API:
– dodawanie nowych prób (action=NEW)
– edytowanie metadanych badań (action=UPDATE) założonych w poprzednich wersjach systemu.