Administrator systemu jest użytkownikiem, który ma uprawnienia m.in. do zakładania kont innym użytkownikom oraz zarządzania nimi. W systemie JSA rozróżniamy dwa rodzaje administratorów
– Administratora instytucji (tylko użytkownik z rolą INST_ADM lub INST_NAUK_ADM w systemie POL-on),
– Administratora JSA tj. użytkownik systemu, któremu nadano rolę „Administracja”.
Administrator instytucji loguje się jako pierwsza osoba z Instytucji i w razie konieczności zakłada kolejne konta dla użytkowników (administratorom JSA lub pozostałym), ustala parametry wyniku, dodaje wykluczenia powtarzających się tekstów czy też uzupełnia dane niezbędne do integracji z systemami uczelnianymi.
W przypadku problemów z logowaniem administrator jest pierwszą osobą, do której powinien się zgłosić użytkownik JSA.
Poniżej mogą się Państwo zapoznać z uprawnieniami Administratora systemu:
| Administrator instytucji | Administrator JSA | |
| rola INST_ADM lub INST_NAUK_ADM w POL-on |  |
 |
| logowanie jako pierwsza osoba z instytucji | |
|
| Tworzenie kont innym administratorom | |
|
| Tworzenie kont innym użytkownikom | |
|
| Odzyskiwania hasła użytkowników | |
|
| Edycja danych konta użytkowników | |
|
| Przeglądanie listy użytkowników | |
|
| Edycja uprawnień użytkowników | |
|
| Podgląd uprawnień użytkowników | |
|
| Zmiana ustawień ogólnych dla instytucji | |
|
| Edycja parametrów wyników | |
|
| Edycja tekstów wykluczeń | |
|
| Podgląd ustawień ogólnych | |
|